生平

少时聪颖过人，十三岁应明末童子试，主考官陈子龙见他年幼，玩笑说：「黄毛未退，亦来应试？」毛奇龄答道：「鹄飞有待，此振先声。」对仗颇工，众人皆惊。清兵南下，与沈禹锡、蔡仲光、包秉德避兵于深山，筑土室读书，曾谓：「元明以来无学人，学人之绝斯三百年矣。」康熙十八年（1679年）举博学鸿儒科二等，授翰林院检讨，充史馆纂修。康熙二十四年（1685年）任会试同考官，康熙二十六年（1687年），因两膝肿胀，关节僵硬，辞职归隐，居杭州竹竿巷兄长毛万龄家。专心著述。康熙五十五年（1716年）病逝。葬于萧山北干后浦滩。

毛奇龄之文章「纵横博辨，傲睨一世」，他反对朱子学，他的弟子收集其旧文编撰《四书改错》以攻击朱熹《四书章句集注》。他还写了一部《仲氏易》，把宋人讲的《易经》推倒。毛奇龄认为周敦颐的《太极图》是来自道教的文献。全祖望平生最恶毛奇龄之书，奋力攻击。又著有《湘湖水利志》3卷、《萧山县县志刊误》3卷等。清初《四库全书》收录其著作二十八种，见于《存目》的三十五种，为《四库全书》中个人著作被收录最多的一位。

家族

毛氏其先出自「注经世业」的《毛诗》注释者。

兄毛万龄。

著作

《毛诗续传》、《古今通韵》、《春秋毛氏传》、《经集》、《竟山乐录》、《乐本解说》、《皇言定声录》、《西河诗话》、《词话》、《四书改错》、《河图洛书原舛编》、《太极图说遗议》，后人编著《西河合集》。